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GW0072 由MedChemExpress提供

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联系方式

公司名MedChemExpress
联系人sales
电 话021-38924433; 021-58955995
手 机18019480960
QQ
电子邮件sales@medchemexpress.cn
网 址http://www.medchemexpress.cn/
地 区上海
邮 编201203

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GW0072的基本信息

中文名化合物 T27505
英文名Benzoic acid, 4-[4-[(2R,5R)-5-[[bis(phenylmethyl)amino]carbonyl]-2-heptyl-4-oxo-3-thiazolidinyl]butyl]-, rel-
别名化合物 T27505
CAS321557-86-2
EINECS
化学式C36H44N2O4S
分子量600.81
inchi
包装信息询盘
价格询价
产品描述GW0072

GW0072

MedChemExpress (MCE)

HY-118097

321557-86-2

请将产品存放在分析证书上推荐的条件下。

美国大陆的室温;其他地方可能有所不同。

GW0072是一种具有灵活离子特性的大分子 ligand,本研究通过针对性的分子动力学模拟了其进入核受体PPARc的配体结合域的过程。从 ligand 位于受体外的 apo-form 开始,模拟最终将 ligand 锁定在结合袋内,得到与 holo-form 非常接近的结构。结果显示,进入过程主要由疏水相互作用引导,并且进入和退出途径非常相似。我们建议 TMD 方法可能有助于区分通过 in silico docking 生成的 ligand。为了解决 ligand 进入过程的问题,我们报道了针对性的分子动力学(TMD)模拟,研究了 GW0072 配体与过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARc)的配体结合域(LBD)的结合。PPARc 是核受体超家族的成员,是许多疾病的重要试剂靶点。我们选择研究这个复合物,因为(i)GW0072 是一种大离子、高度灵活的配体,包括脂肪链和极性基团;(ii)先前的模拟已经定义了该配体的可能逃逸途径。从 apo-form 的受体(PDB.ID 1PRG,A链)开始,配体位于外部,TMD 模拟收敛于接近目标结构的 holo-form 复合物(PDB.ID 4PRG,A链),定义了一个与逃逸途径非常相似的进入结合袋的渗透途径。但在 GW0072 进入受体的过程中(图 5),螺旋非常移动,一旦配体放置在口袋中,AF-2 在剩余模拟期间变得更加僵硬(图 S1 在补充材料中)。这一发现与 Oberfield 等人 [12] 的观察结果非常一致,表明尽管没有直接与配体的相互作用,但配体在结合位点的存在稳定了 AF-2 的中间构象,这可能是 GW0072 作为部分激动剂的性质的原因。

GW0072 是 PPARγ 的部分激动剂,不直接与 PPARγ 的 AF-2 螺旋结合,从而产生特定的部分受体转录激活特性[1][2]。

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[1]. Ligand entry pathways in the ligand binding domain of PPARc receptor

产品链接https://www.medchemexpress.cn/gw0072.html
更新日期2025-05-21 16:50:25

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